目前国内唯一能做绿色食品认证的，是农业部下属的中国绿色食品发展中心（CGFDC）。中心认定颁发的绿色食品分两个等级：A级标志为绿底白字，AA级为白底绿字。凡绿色食品在包装上都同时印有绿色食品标志，以及经“中国绿色食品发展中心许可使用绿色食品标志”字样的文字和批准号，做到标志图形、“绿色食品”中英文、编号“四位一体”。
绿色食品标志旁还印有企业信息码，由英文字母GF（green food）和12位数字组成，前6位代表“地区代码”，中间两位代表“获证年份”，后4位代表“当年获证企业序号”。消费者可以根据信息码登录中国绿色食品网查证。
纯天然食品不一定是绿色食品。纯天然是指在自然环境中生长，并没有严格的控制标准。有些“天然”产品由于在受污染的地方生长，也不是健康食品。无论是用农家有机肥，还是不使用化肥的产品，只有经专门机构认定、被许可使用绿色食品标志商标的，才是绿色食品。
