郭文奇指出，2016年抽检中，不合格产品主要问题有：一是超范围、超限量使用食品添加剂，占不合格样品的33.6%。二是微生物污染，占不合格样品的30.7%，其中因致病性微生物导致的不合格样品占此类不合格的25.6%。三是质量指标不符合标准，占不合格样品的17.5%。四是重金属等元素污染，占不合格样品的8.2%。五是农药兽药残留不符合标准，占不合格样品的5.5%。六是生物毒素污染，占不合格样品的1.1%。七是检出非食用物质，占不合格样品的0.7%。八是其他问题，占不合格样品的2.7%。
导致这些问题的原因主要有：一是源头污染，包括土壤、水源等环境污染导致重金属和有机物在动植物体内蓄积，农药兽药、农业投入品的违规使用导致农药兽药残留等超标；二是生产经营过程管理不当，比如生产、运输、贮存等环节的环境或卫生条件控制不到位，生产工艺不合理，出厂检验未落实等；三是当前基层监管人员总体能力水平与监管任务在一定程度上存在不适应。
郭文奇表示，针对抽检发现的问题，食品药品监管总局组织各地食品药品监管部门对不合格食品及其生产经营单位及时采取处置措施，2016年共处置生产经营单位9264件次，罚没总额达1.2亿元，下架封存不合格食品428.2吨、召回326.9吨。食品安全监督抽检和处置信息由各级食品药品监管部门按照规定向社会公布。
