茄子褐纹病病菌发育最适合温度为28℃～30℃，相对湿度为80%以上，高温高湿、阴雨连绵、连年重茬、密度过大、氮肥施用过多，都会引起该病的发生和流行。其防治方法如下：
农业防治：播种前用55℃的水浸种10～15分钟，或用福尔马林浸种15分钟，再用清水冲洗后催芽播种。与非茄科作物实行2～3年以上的轮作。施足基肥，增施磷钾肥，不偏施氮肥。浇水时要小水勤浇，畦面要见干见湿。合理密植，及时整枝打杈，提高田间通风透光性。
药剂防治：播种时每平方米用50%多菌灵可湿性粉剂10克，50%福美双可湿性粉剂10克，混合后拌细土2公斤制成药土，取1/3撒在畦面上播种，然后将剩下的药土覆盖在种子上面。
苗期发病，可喷施50%克菌丹500倍液，或60%福美锌500倍液。定植后可在茎基部撒施草木灰或石灰粉杀菌。结果期可喷施40%福星5000～6000倍液，或80%新万生可湿性粉剂500～800倍液，或万霉灵可湿性粉剂500～800倍液，或43%福力库4000倍液。每隔7～10天喷1次，连喷2～3次。为防止产生抗药性，以上农药可交替使用。