芹菜软腐病又称腐烂病、腐败病，是一种细菌性土传病害，一般在生长中后期封垄遮荫、地面潮湿的情况下易发病。
病菌主要在土壤中越冬，通过昆虫、操作、雨水或灌溉水等传播，从伤口侵入，发病后，可通过雨水或灌溉水传播蔓延。发病适温２５－３０℃，雨水多或浇水过勤，湿度大，发病多。伤口多，重茬地，低洼地、排水不良的地，发病重。芹菜腐烂病的防治措施如下：
（１）实行两年以上轮作。选用抗病品种，无病土育苗。
（２）避免伤根，培土切勿过高，雨季注意排水，发病期尽量少浇水或停止浇水。一旦发现病株应及时拔除，病穴用１：２０倍福尔马林消毒或换客土，也可撒一些石灰消毒土壤。
（３）用农抗７５１粉剂或丰灵可溶性粉剂，按种子重量的１％拌种后播种，或用２％农抗７５１水剂１００倍液１５毫升拌２００克种子，晾干后播种。
（４）在播种沟内，用２％农抗７５１水剂５公斤或丰灵可溶性粉剂１公斤，加水５０公斤，均匀施在一亩地的垄沟内。
（５）苗期用丰灵可溶性粉剂５００克，加水５０公斤，浇灌根部和喷洒叶柄及基部，或在浇水时，每亩随水加入农抗７５１水剂２－３公斤。
（６）发病初期，可喷农用链霉素或新植霉素１００－１５０ｐｐｍ倍液，隔７天喷１次，连喷２－３次。也可用３０％ＤＴ可湿性粉剂４００－５００倍液或９５％ＣＴ杀菌剂６００倍液或７７％可杀得可湿性粉剂６００－８００倍液或７０％敌克松可湿性粉剂７００倍液等，喷洒植株和浇灌根颈部，１０天后再喷灌１次。